Hingga muncul kalimat dari diri Syekh Siti Jenar yang benar-benar dimabuk cinta kepada tuhannya yaitu satu kalimat, Allah wujud, dan wujud Allah adalah Syekh Siti Jenar. Di Nusantara lebih dikenal Manunggaling Kaulo Gusti.
Tingkatan Syekh Siti Jenar yang begitu tinggi karena ilmu hakikatnya, ini yang dirasa meresahkan oleh Sunan Kalijaga karena akan sangat fatal ketika awam yang salah tafsir dengan ajaran Syekh Siti Jenar.
Ditakutkan nantinya pengikut Syekh Siti Jenar akan menganggap bahwa wujud Allah itu adalah Syekh Siti Jenar, maka dewan wali memutuskan untuk menghakimi Syekh Siti Jenar demi menyelamatkan umat dari pemahaman yang salah dan fatal nantinya. *