Beberapa peninggalannya yang masyhur di masyarakat adalah ajian-ajian Waringin Sungsang dan beberapa benda pusaka yang hingga saat ini masih dilestarikan.
Ajian waringin sungsang sendiri merupakan ilmu kanuragan yang mampu menyerap kesaktian lawan hingga habis tidak tersisa. Umumnya mereka yang dihancurkan adalah para penganut ilmu hitam yang merugikan orang lain.
Untuk benda pusaka Sunan Kalijaga meninggalkan sebuah warisan berupa rompi bernama Ontokusumo, yang disebut-sebut digunakan untuk menundukkan pemimpin bangsa jin di laut Selatan. *