Beliau meninggal karena sakit ringan. Hampir seluruh ulama dan Habib termasuk masyarakat di tanah air banyak yang ikut menshalatkan dan mengantarkan ke tempat peristirahatannya.
Sekarang Pondok Pesantren Al-Falak dikelola oleh buyutnya (generasi IV) Abah-Falak yang tinggal di Pagentongan, dan Pondok Pesantren Al-Falak tetap konsisten untuk membantu pemerintah dalam membangun sumber daya manusia yang islami. Sholu 'ala Nabi Muhammad.***